ライフサイエンスデータベースセンターに行った際にお聞きして、これは紹介せねばと思いつつ、そのままになってました。すみません。バイオ関係の様々なツール(塩基配列、タンパク質、パスウェイ情報、文献検索...など)の使い方を動画で説明しています。とても親切です。早回しもあると便利なんだけど・・・。 続きを読む
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25,000以上のヒトのタンパク質、37,000以上のタンパク質間相互作用などが登録されているJohns Hopkins大学のDr. Pandeyの研究室のデータベース。専門家がマニュアルでチェックすることで信頼性を向上させている。発現分布や相互作用タンパク質のデータが報告されている論文にリンクさ 続きを読む
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今日 Citeulikeを登録してくださったかたがいたので、このBiowizardを思いだして登録。当サイト バイオブックマークも、実はこのBioWizardをみて、こんなの面白いな、と思ったのがきっかけ。voteの数が 続きを読む
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タンパク質のin vivoリン酸化サイトと、その反応を触媒するであろうリン酸化酵素との対応を予想するサイトです。リン酸化酵素のリン酸化motifの情報( Scansite 続きを読む
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STRINGは、実験データや文献からのデータマイニング、ゲノム情報などからつくられた、膨大な数のタンパク質間相互作用のデータベースです。現在のリリース(release 7) では、まだ相互作用予測にタンパク質の局在までは考慮していないようですが、個々の相互作用がprobability scoreと 続きを読む
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Google のサーチアルゴリズムとして一躍有名になったPageRank。個々のWeb サイトに重要度の格付けもたらすものだ。現在onlineにある学術誌 5709タイトルをこのPageRankで評価すると、トップはThe Journal of Biological Chemistry (JBC) 続きを読む
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世界で行われている全てのゲノムプロジェクトを統合するサイトです。ゲノムプロジェクトが終了した579,進行中の古細菌63,細菌1222,真核生物721,メタゲノム(微生物を分離しないやるプロジェクト)95の計2680プロジェクト(2007年6月20日現在)情報が整理されています。ネーミングがカッコい 続きを読む
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依然として"ベータ"とついてはいるが、さすがGoogleというべき高速全文検索が可能。海外では、巨大な資金力をもつGoogle によるアカデミック分野での"情報支配"をあえて望む声もあるらしい。 続きを読む
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